A Kurosu Akadémia azért jött létre, hogy emberek és vámpírok békésen élhessenek együtt.

„A Cross Akadémia egy tekintélyes magániskola, ami két csoporta ossza a diákokat: az esti tagozatra és a nappali tagozatra. A nappali és esti tagozatosok megosztják egymás között az iskola termeit. De amikor osztálycserére kerül a sor, mindig kitör a teljes káosz. Az oka annak, hogy a nappalisok miért tömörülnek az estisek körül az, hogy az estisek egy elit csapat. És mind teljesen csodásak. ... az esti tagozatosok nem csak egy elit csapat gyönyörű emberekkel. A titok amit senki más nem tud az esti tagozatosokról, hogy mindannyian vámpírok.”

Kurosu Yuuki minden emlékét elveszti egy havas, szörnyű estén, amikor egy vámpír fel akarja falni, de egy másik megmenti őt, egy kedves vámpír akit Kuran Kanaménak hívnak. Kaname elviszi Yuukit egy Kaien nevezetű emberhez, hogy nevelje fel. Kaien, a volt vámpírvadász és most a Kurosu Akadémia igazgatója ezer örömmel fogajda a kislányt.  Később, Kiryuu Zero kerül a családhoz, kinek szüleit, a híres vámpírvadászokat egy Hio Shizuka nevű tisztavérű vámpír ölte meg, Zerot megharapta, ikertestvérét, Ichirut pedig magával vitte. Zero ezután kerül Yuukiékhoz, ahol nagyon sokáig még csak meg sem szólalt. Ahogy teltek múltak a napok Yuukival együtt az iskola prefektusai lettek, hogy távol tartsák a nappalisokat az estisektől.

Mivel Zerot egy tisztavérű vámpír harapta meg, ő is kezd vámpírrá válni, de ezt nem csak ő veszi észre, hanem a másik tisztavérű is, Kuran Kaname. Yuuki próbál segíteni Zeronak azáltal, hogy engedi, hogy igyon a véréből még mielőtt egy „E” osztályos vámpírrá válna. Hogy megállítsa ezt a folyamatot, Kaname a saját vérét adja Zeronak, bár ahhoz, hogy a vámpír állapotot stabilizálhassa, annak a vérét kellene meginnia aki először harapta meg őt.

Ezekután a dolgot bonyolodnak, az Akadémiára kerül egy Kurenai Maria nevű vámpír, akiről megtudjuk, hogy nem ez az igazi neve, meg hogy kihez is van köze, sőt, hogy ki az, aki őt szolgálja. Feltűnik majd még egy vámpír is, egy tisztaverű, akit Rido Kurannak hívnak, kiderül, hogy Yuuki Kuran húga, a Tisztaverű Hercegnő a Kuran klánból. Rido most újra megpróbálja megölni Yuukit, ahogy azt a múltban is szerette volna, Yuuki viszont nem hagyja magát. Zero is segít neki, de közli vele, hogy ha legközelebb látják egymást, meg kell őt ölnie, mivel Zero vámpírvadász Yuuki meg egy vámpír. Yuuki erre azt válaszolja, hogy menekülni fog előle, úgyhogy Zeronak lesz oka miért élni.

Az animének itt van vége, a manga még folytatódik.